<b>Étiologies des gastro-entérites infectieuses au Centre Hospitalier Universitaire Pédiatrique Charles de Gaulle à Ouagadougou, Burkina Faso</b>

Abstract

Resumé Introduction Les gastro-entérites infectieuses constituent l'une des principales causes de morbidité et de mortalité à l'échelle mondiale, en particulier chez les enfants. L'objectif de la présente étude était d'identifier les agents étiologiques responsables des infections gastro-entériques au Centre Hospitalier Universitaire Pédiatrique Charles-de-Gaulle (CHUP-CDG) de Ouagadougou au Burkina Faso. Méthodologie Il s’est agi d’une étude transversale et descriptive à collecte ponctuelle rétrospective menée au laboratoire du Centre Hospitalier Universitaire Pédiatrique Charles-de-Gaulle sur une période de treize (13) mois allant de novembre 2016 à décembre 2017. La population d'étude comprenait l'ensemble des dossiers de patients pour lesquels un examen parasitologique des selles, une coproculture bactérienne et/ou une recherche d'antigènes viraux entériques par immunochromatographie avait été réalisés. Résultats Sur 1 842 échantillons de selles analysés, au moins un agent pathogène a été identifié chez 233 patients, soit une prévalence globale de 12,6 % (IC 95 % : 11,2-14,3 %). Les patients de sexe masculin étaient les plus représentés (52,7 % ; n = 970), avec un sex-ratio de 1,1. La tranche d'âge la plus représentée était celle des nourrissons de 1 à 11 mois (38,9 % ; n = 687). Les parasites constituaient les agents pathogènes les plus fréquemment identifiés (93,1 % ; n = 217), dominés par Giardia intestinalis (35,2 % ; n = 82) et Entamoeba coli (30,0 % ; n = 70). Les bactéries représentaient 4,3 % des isolats (n = 10), avec une prédominance de Escherichia coli (3,4 % ; n = 8). Les virus (2,1 % ; n = 5) étaient dominés par le rotavirus (1,3 % ; n = 3), et les levures par le genre Candida (4,3% ; n = 10). Des résistances aux antimicrobiens ont été observées notamment aux bêta-lactamines pour 75 % des souches de Escherichia coli, et aux fluoroquinolones. Conclusion Giardia intestinalis constitue le principal agent étiologique des gastro-entérites infectieuses dans cette population pédiatrique. Entamoeba coli, bien que non pathogène, est le deuxième parasite le plus fréquemment isolé, témoignant d'un niveau d'hygiène précaire et d'une contamination fécale persistante. Les bactéries, les virus et les levures complètent ce spectre étiologique. Ces résultats soulignent la nécessité de renforcer les stratégies diagnostiques, les mesures d'hygiène et la surveillance de la résistance aux antimicrobiens. Abstract Background Infectious gastroenteritis remains one of the leading causes of morbidity and mortality worldwide, particularly among children. The objective of this study was to identify the etiological agents responsible for gastroenteric infections at the Charles-de-Gaulle Pediatric University Hospital (CHUP-CDG) in Ouagadougou, Burkina Faso. Methods A retrospective cross-sectional descriptive study was conducted at the laboratory of the Charles-de-Gaulle Pediatric University Hospital over a 13-month period, from November 2016 to December 2017. The study population included all records of patients who underwent parasitological stool examination, bacterial stool culture, and/or detection of enteric viral antigens by immunochromatography. Results Of the 1,842 stool samples analyzed, at least one pathogen was identified in 233 patients, representing an overall prevalence of 12.6% (95% CI: 11.2-14.3%). Male patients were the most represented (52.7%; n = 970), with a sex ratio of 1.1. The most frequent age group was infants aged 1 to 11 months (38.9%; n = 687). Parasites were the most commonly identified pathogens (93.1%; n = 217), dominated by Giardia intestinalis (35.2%; n = 82) and Entamoeba coli (30.0%; n = 70). Bacteria accounted for 4.3% of isolates (n = 10), with a predominance of Escherichia coli (3.4%; n = 8). Viruses (2.1%; n = 5) were dominated by rotavirus (1.3%; n = 3), and yeasts by the genus Candida (4.3%; n = 10). Antimicrobial resistance was observed, notably to beta-lactams in 75% of Escherichia coli strains, as well as to fluoroquinolones. Conclusion Giardia intestinalis was the primary etiological agent of infectious gastroenteritis in this pediatric population. Although non-pathogenic, Entamoeba coli was the second most frequently isolated parasite, reflecting poor hygiene levels and persistent fecal contamination in the children's environment. Bacteria, viruses, and yeasts further contribute to the etiological spectrum. These findings underscore the necessity of strengthening diagnostic strategies, improving hygiene measures, and enhancing antimicrobial resistance surveillance.